El Doctorado en Ciencias Informáticas está en el extremo superior de la pirámide y se enfoca principalmente en la generación de nuevos conocimientos, metodologías o técnicas aplicables en la disciplina Informática.
La estructura de la carrera incorpora (además de los cursos por créditos y una Tesis con publicaciones previas) una estadía mínima de investigación de 6 meses en un Laboratorio/Centro/Instituto reconocido en la UNLP u otra Universidad.